MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008340	GCG	2	6	146031	146036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319290
3502	NC_008340	GGA	2	6	146051	146056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319290
3503	NC_008340	GGAGCC	2	12	146093	146104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319290
3504	NC_008340	CGC	2	6	146110	146115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319290
3505	NC_008340	GCC	2	6	146118	146123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319290
3506	NC_008340	CTG	2	6	146249	146254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_008340	GAT	2	6	146261	146266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_008340	GTT	2	6	146291	146296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_008340	GGGCG	2	10	146327	146336	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3510	NC_008340	CGC	2	6	146388	146393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319291
3511	NC_008340	GAC	2	6	146421	146426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319291
3512	NC_008340	AGC	2	6	146440	146445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319291
3513	NC_008340	GCC	2	6	146464	146469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319291
3514	NC_008340	TCA	2	6	146503	146508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319291
3515	NC_008340	GCGG	2	8	146519	146526	0 %	0 %	75 %	25 %	114319291
3516	NC_008340	CG	3	6	146643	146648	0 %	0 %	50 %	50 %	114319291
3517	NC_008340	CGC	2	6	146661	146666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319291
3518	NC_008340	GCA	2	6	146725	146730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319291
3519	NC_008340	CCAT	2	8	146791	146798	25 %	25 %	0 %	50 %	114319291
3520	NC_008340	GC	3	6	146813	146818	0 %	0 %	50 %	50 %	114319291
3521	NC_008340	CGGT	2	8	146856	146863	0 %	25 %	50 %	25 %	114319291
3522	NC_008340	GGC	2	6	146864	146869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319291
3523	NC_008340	CAC	2	6	146942	146947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319291
3524	NC_008340	CGG	2	6	146993	146998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319291
3525	NC_008340	GCC	2	6	147004	147009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319291
3526	NC_008340	CCG	2	6	147034	147039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319291
3527	NC_008340	CTG	2	6	147117	147122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319291
3528	NC_008340	GTC	2	6	147150	147155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319291
3529	NC_008340	CTG	2	6	147168	147173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319291
3530	NC_008340	ACA	2	6	147181	147186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319291
3531	NC_008340	CGC	2	6	147255	147260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319291
3532	NC_008340	TGA	2	6	147280	147285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319291
3533	NC_008340	GGC	3	9	147305	147313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319291
3534	NC_008340	CCGAG	2	10	147319	147328	20 %	0 %	40 %	40 %	114319291
3535	NC_008340	GTG	2	6	147336	147341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319291
3536	NC_008340	TGG	2	6	147370	147375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319291
3537	NC_008340	CA	3	6	147379	147384	50 %	0 %	0 %	50 %	114319291
3538	NC_008340	GCGG	2	8	147392	147399	0 %	0 %	75 %	25 %	114319291
3539	NC_008340	AGC	2	6	147646	147651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319291
3540	NC_008340	CTG	3	9	147663	147671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319291
3541	NC_008340	TGG	2	6	147706	147711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319291
3542	NC_008340	ACC	2	6	147787	147792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319291
3543	NC_008340	GAT	2	6	147821	147826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319291
3544	NC_008340	GGC	2	6	147865	147870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319291
3545	NC_008340	GCT	2	6	147905	147910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319291
3546	NC_008340	CCAG	2	8	147982	147989	25 %	0 %	25 %	50 %	114319291
3547	NC_008340	CTG	2	6	148040	148045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319291
3548	NC_008340	TGT	2	6	148050	148055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_008340	AATC	2	8	148084	148091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3550	NC_008340	GGT	2	6	148118	148123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319292
3551	NC_008340	GCC	2	6	148165	148170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319292
3552	NC_008340	GGC	2	6	148234	148239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319292
3553	NC_008340	CCG	2	6	148320	148325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319292
3554	NC_008340	CG	3	6	148335	148340	0 %	0 %	50 %	50 %	114319292
3555	NC_008340	CGG	2	6	148346	148351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319292
3556	NC_008340	GGT	2	6	148437	148442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319292
3557	NC_008340	ACC	2	6	148472	148477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319292
3558	NC_008340	GAA	2	6	148486	148491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319292
3559	NC_008340	GGGC	2	8	148509	148516	0 %	0 %	75 %	25 %	114319292
3560	NC_008340	CAG	2	6	148561	148566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319292
3561	NC_008340	CCCTCG	2	12	148574	148585	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114319292
3562	NC_008340	GGCA	2	8	148598	148605	25 %	0 %	50 %	25 %	114319292
3563	NC_008340	CGG	3	9	148622	148630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319292
3564	NC_008340	GAA	2	6	148642	148647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319292
3565	NC_008340	GCC	2	6	148714	148719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319292
3566	NC_008340	CCCAG	2	10	148776	148785	20 %	0 %	20 %	60 %	114319292
3567	NC_008340	CT	3	6	148834	148839	0 %	50 %	0 %	50 %	114319292
3568	NC_008340	CGG	2	6	148900	148905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319292
3569	NC_008340	TCG	2	6	149080	149085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319293
3570	NC_008340	CCA	2	6	149096	149101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319293
3571	NC_008340	TCG	2	6	149161	149166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319293
3572	NC_008340	GGC	2	6	149169	149174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319293
3573	NC_008340	ATG	2	6	149260	149265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319293
3574	NC_008340	GCCG	2	8	149271	149278	0 %	0 %	50 %	50 %	114319293
3575	NC_008340	GCG	2	6	149283	149288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319293
3576	NC_008340	CCGGT	2	10	149299	149308	0 %	20 %	40 %	40 %	114319293
3577	NC_008340	GTC	2	6	149442	149447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319293
3578	NC_008340	CCA	2	6	149450	149455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319293
3579	NC_008340	G	6	6	149600	149605	0 %	0 %	100 %	0 %	114319293
3580	NC_008340	CTG	2	6	149606	149611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319293
3581	NC_008340	CAC	2	6	149648	149653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319293
3582	NC_008340	CCG	2	6	149703	149708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319293
3583	NC_008340	CGG	2	6	149723	149728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319293
3584	NC_008340	CTC	2	6	149760	149765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319293
3585	NC_008340	TTG	2	6	149773	149778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319293
3586	NC_008340	GCA	2	6	149805	149810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319293
3587	NC_008340	AGGC	2	8	149812	149819	25 %	0 %	50 %	25 %	114319293
3588	NC_008340	GAG	2	6	149854	149859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319293
3589	NC_008340	CGA	2	6	149939	149944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319293
3590	NC_008340	TGC	2	6	149993	149998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319293
3591	NC_008340	GAA	2	6	150006	150011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319293
3592	NC_008340	GTC	2	6	150024	150029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319293
3593	NC_008340	CG	4	8	150075	150082	0 %	0 %	50 %	50 %	114319293
3594	NC_008340	TGC	2	6	150094	150099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319293
3595	NC_008340	GC	3	6	150105	150110	0 %	0 %	50 %	50 %	114319293
3596	NC_008340	GCA	2	6	150140	150145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319293
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3599	NC_008340	CAC	2	6	150285	150290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319293
3600	NC_008340	AG	3	6	150337	150342	50 %	0 %	50 %	0 %	114319293
3601	NC_008340	GCA	2	6	150400	150405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319293
3602	NC_008340	TGG	2	6	150421	150426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319293
3603	NC_008340	GCTGTA	2	12	150435	150446	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114319293
3604	NC_008340	TGG	2	6	150511	150516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319293
3605	NC_008340	TCT	2	6	150548	150553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319293
3606	NC_008340	TGT	2	6	150584	150589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_008340	TGCC	2	8	150598	150605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_008340	GGC	2	6	150677	150682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_008340	CCG	2	6	150686	150691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_008340	GTG	2	6	150775	150780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319294
3611	NC_008340	AGGA	2	8	150794	150801	50 %	0 %	50 %	0 %	114319294
3612	NC_008340	AGT	2	6	150831	150836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319294
3613	NC_008340	CCA	3	9	150945	150953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319294
3614	NC_008340	TGG	2	6	151034	151039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319294
3615	NC_008340	AGT	2	6	151068	151073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319294
3616	NC_008340	CGG	2	6	151133	151138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319294
3617	NC_008340	AGC	2	6	151175	151180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319294
3618	NC_008340	AGCC	2	8	151190	151197	25 %	0 %	25 %	50 %	114319294
3619	NC_008340	CAG	2	6	151210	151215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319294
3620	NC_008340	G	6	6	151274	151279	0 %	0 %	100 %	0 %	114319294
3621	NC_008340	CGT	2	6	151395	151400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319294
3622	NC_008340	GGC	2	6	151432	151437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319294
3623	NC_008340	CCG	2	6	151461	151466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319294
3624	NC_008340	GTC	2	6	151531	151536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319294
3625	NC_008340	TCG	2	6	151547	151552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319294
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3653	NC_008340	GGTG	2	8	152441	152448	0 %	25 %	75 %	0 %	114319294
3654	NC_008340	CGT	3	9	152584	152592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319295
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3728	NC_008340	GGCCC	2	10	155468	155477	0 %	0 %	40 %	60 %	114319297
3729	NC_008340	GTCG	2	8	155516	155523	0 %	25 %	50 %	25 %	114319297
3730	NC_008340	CGG	2	6	155561	155566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319297
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3739	NC_008340	CGT	2	6	155876	155881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319297
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3971	NC_008340	CGGCAG	2	12	164497	164508	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319304
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3974	NC_008340	CGGCA	2	10	164563	164572	20 %	0 %	40 %	40 %	114319304
3975	NC_008340	GGCTCG	2	12	164606	164617	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319304
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3980	NC_008340	GCA	2	6	164781	164786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319304
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3982	NC_008340	GTC	2	6	164860	164865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319304
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3984	NC_008340	GAA	2	6	164950	164955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319304
3985	NC_008340	TCG	2	6	164963	164968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319304
3986	NC_008340	CCG	2	6	165016	165021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319304
3987	NC_008340	GGT	2	6	165114	165119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319304
3988	NC_008340	CGG	2	6	165125	165130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319304
3989	NC_008340	GGT	2	6	165144	165149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319304
3990	NC_008340	GCC	2	6	165164	165169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319304
3991	NC_008340	GCGG	2	8	165175	165182	0 %	0 %	75 %	25 %	114319304
3992	NC_008340	GTC	2	6	165211	165216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319304
3993	NC_008340	CGA	2	6	165219	165224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319304
3994	NC_008340	GCC	2	6	165226	165231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319304
3995	NC_008340	GCA	2	6	165297	165302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319304
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3997	NC_008340	GAACAG	2	12	165331	165342	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	114319304
3998	NC_008340	GC	3	6	165359	165364	0 %	0 %	50 %	50 %	114319304
3999	NC_008340	CAGC	2	8	165380	165387	25 %	0 %	25 %	50 %	114319304
4000	NC_008340	CGT	2	6	165475	165480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319304

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